يعتبر خبراء التغذية والأطباء الحبوب الكاملة غذاءً صحياً غنياً بالمغذيات الضرورية، ويوصون بإدراجها ضمن نظام غذائي متوازن، لكنها تحمل في طياتها جانباً خفياً قد يكون ضاراً، إذ تحذر الأبحاث من احتمالية تلوثها بسموم فطرية تنتجها أنواع مختلفة من الفطريات أثناء نموها في الحقول أو بعد الحصاد، وحتى خلال مراحل التعبئة والتخزين، تظهر هذه السموم خاصةً في الظروف المساعدة على نمو العفن، مثل ارتفاع مستويات الرطو